現代動(dòng)物分類(lèi)學(xué)導論簡(jiǎn)介，目錄書(shū)摘

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內容簡(jiǎn)介:正如人類(lèi)社會(huì )在各方面的進(jìn)步一樣，科學(xué)技術(shù)各領(lǐng)域在近20年來(lái)所呈現出的面貌是加速發(fā)展而不只是發(fā)展，動(dòng)物分類(lèi)學(xué)也是如此。雖然動(dòng)物分類(lèi)工作者并未普遍認為這個(gè)領(lǐng)域近年來(lái)發(fā)生了革命性的變化，但是各個(gè)方向上不同程度進(jìn)展的總和卻是驚人的。如何使初學(xué)者能夠更快地了解動(dòng)物分類(lèi)學(xué)的全貌與現狀，并有效率地開(kāi)展工作，這是一個(gè)挑戰?！冬F代動(dòng)物分類(lèi)學(xué)導論》以“新技術(shù)為分類(lèi)學(xué)所用”為原則，整理了動(dòng)物分類(lèi)學(xué)的傳統內容，系統性地介紹了分子系統學(xué)等新技術(shù)方面的基本內容，同時(shí)非常重視這兩部分內容之間的聯(lián)系，并對一些重點(diǎn)內容展開(kāi)論述。

作者簡(jiǎn)介:

目錄:目錄
序一
序二
前言
第一部分 動(dòng)物分類(lèi)學(xué)初步
第1章 動(dòng)物分類(lèi)學(xué)簡(jiǎn)史 3
1.1 林奈之前 4
1.2 林奈與布豐 6
1.3 拉馬克與居維葉及其他學(xué)者 7
1.4 達爾文與華萊士 8
1.5 邁爾與亨尼希 9
1.6 分支分類(lèi)學(xué)派、進(jìn)化分類(lèi)學(xué)派與數值分類(lèi)學(xué)派 11
1.7 今天的動(dòng)物分類(lèi)學(xué) 12
第2章 系統學(xué)的項目設計、樣本采集與保存 l4
2.1 針對問(wèn)題的形態(tài)特征或分子標記選取 14
2.1.1 種群結構研究 14
2.1.2 種間界限與種群間雜交研究 15
2.1.3 高級階元系統發(fā)育研究 15
2.2 針對類(lèi)群行為特點(diǎn)的采集方法 16
2.2.1 采集策略 16
2.2.2 采集方法 16
2.3 針對個(gè)體結構特點(diǎn)的保存方法 19
第二部分 動(dòng)物分類(lèi)學(xué)的經(jīng)典內容和α分類(lèi)的新內容
第3章 《國際動(dòng)物命名法規》第四版概述 23
3.1 雙名法及若干相關(guān)問(wèn)題 24
3.2 《法規》對于電子出版物的態(tài)度 24
3.3 可用名 25
3.4 優(yōu)先權和有效名 26
3.5 各階元的名稱(chēng)構成及使用 27
3.5.1 科級分類(lèi)單元 27
3.5.2 屬級分類(lèi)單元 27
3.5.3 種級分類(lèi)單元 28
3.6 異名關(guān)系 30
3.7 同名關(guān)系 31
3.8 模式 33
3.8.1 科級分類(lèi)單元 33
3.8.2 屬級分類(lèi)單元 34
3.8.3 種級分類(lèi)單元 36
3.9 展望 38
第4章 動(dòng)物分類(lèi)學(xué)的經(jīng)典工作內容 40
4.1 鑒定 40
4.2 描述、繪圖和照相 42
4.3 修訂及新命名分類(lèi)單元的記述 43
4.4 階元層級與分類(lèi)系統 44
4.5 檢索表 45
4.6 地理分布 46
第5章 形態(tài)學(xué)新技術(shù)的引入 48
5.1 數字化繪圖 48
5.2 電子顯微鏡 50
5.3 激光共聚焦顯微鏡 52
5.4 微型斷層掃描 54
5.5 幾何形態(tài)學(xué) 55
5.6 全形態(tài) 56
5.7 分類(lèi)學(xué)的網(wǎng)絡(luò )化時(shí)代 57
第6章 無(wú)法統一的物種概念 60
6.1 生物學(xué)類(lèi)的物種概念 62
6.2 生物學(xué)物種概念在現實(shí)中的困難 62
6.3 系統發(fā)育類(lèi)的物種概念 63
第7章 分子鑒定：DNA條形編碼 68
7.1 標記的選定 69
7.2 鑒定的算法 72
7.3 結果的采用 72
7.4 BOLD數據庫規范簡(jiǎn)介 73
7.4.1 項目立項的規范 73
7.4.2 數據提交的規范 73
7.5 DNA條形碼能否助力譜系物種概念和譜系命名法規？ 74
7.5.1 譜系命名法規概述 74
7.5.2 Barcoding、PSC和Phylocode 75
7.6 轉基因生物與合成生物學(xué) 76
第三部分 生物地理學(xué)概述
第8章 物種形成：種群遺傳和地理 81
8.1 種化方式與地理之間的關(guān)系 81
8.2 種群遺傳分異與生態(tài)因素的協(xié)同 83
8.3 種群遺傳動(dòng)態(tài) 83
第9章 物種地理分布格局：地質(zhì)與生態(tài) 87
9.1 物種分異與地質(zhì)歷史的協(xié)同 87
9.1.1 第四紀及其之前的歷史梗概 87
9.1.2 第四紀冰期與間冰期 90
9.1.3 人類(lèi)的擴散遷移及其影響 92
9.2 階元級別與分布格局形成機制的解釋 96
9.2.1 擴散理論 96
9.2.2 泛生物地理學(xué) 96
9.2.3 分支生物地理學(xué) 97
9.3 生態(tài)因子對物種分布的限制 99
第四部分 系統發(fā)育
第10章 系統發(fā)育系統學(xué)與分支分析 105
10.1 相似與同源 105
10.2 類(lèi)群相關(guān)概念 106
10.3 特征相關(guān)概念 107
10.3.1 性狀選取與性狀狀態(tài) 107
10.3.2 性狀評價(jià)與性狀加權 108
10.3.3 性狀的區分 109
10.4 樹(shù)圖相關(guān)概念 109
10.4.1 Hennig論證 110
10.4.2 筒約原則與樹(shù)長(cháng) 110
10.4.3 樹(shù)的搜索 111
10.4.4 樹(shù)的合意 112
10.4.5 樹(shù)的評價(jià)與檢驗 112
10.4.6 若干問(wèn)題 113
10.5 主干種 114
10.6 分支圖與分類(lèi)系統 115
10.6.1 Hennig的同等級別法 116
10.6.2 Wilev等(1991)提出的三個(gè)規則 116
10.6.3 9個(gè)約定 116
10.7 樹(shù)的其他用途 117
10.8 分子系統發(fā)育 117
10.9 不同信息來(lái)源結果的整合 119
10.9.1 古DNA和古蛋白質(zhì) 119
10.9.2 超級樹(shù) 120
10.10 基于形態(tài)信息與基于分子信息的分支分析研究 121
第11章 分子系統學(xué)的實(shí)驗部分 128
11.1 核酸提取 129
11.1.1 DNA的提取 130
11.1.2 線(xiàn)粒體基因組的純化分離 134
11.1.3 RNA的提取 135
11.2 PCR技術(shù)、純化回收與克隆 137
11.2.1 一般的PCR 139
11.2.2 巢式PCR 141
11.2.3 增效PCR 142
11.2.4 TAIIL-PCR 142
11.2.5 反轉錄PCR 143
11.2.6 長(cháng)PCR 144
11.2.7 純化回收與克隆 145
11.3 序列測定與拼接和申報 147
11.3.1 Sanger法測序原理 147
11.3.2 短片段直接測序 148
11.3.3 高通量測序 148
11.3.4 單分子測序 150
11.3.5 序列拼接和申報 151
第12章 分子系統學(xué)的生物信息學(xué)部分 153
12.1 序列數據庫建立 153
12.1.1 序列數據的收集 153
12.1.2 標本信息與序列信息的整合 153
12.2 序列格式與轉換 154
12.2.1 序列格式類(lèi)型 154
12.2.2 常用的轉換軟件 155
12.3 線(xiàn)粒體基因組分析 155
12.3.1 動(dòng)物線(xiàn)粒體基因組簡(jiǎn)況 156
12.3.2 蛋白質(zhì)編碼基因、rDNA和tRNA 156
12.4 EST與核基因組分析 156
12.4.1 EST 157
12.4.2 核基因組 158
12.5 短片段序列比對 160
12.5.1 短片段序列比對的一般方案 161
12.5.2 空位的問(wèn)題以及POY軟件所做的比對 163
12.5.3 蛋白質(zhì)編碼基因的手工比對 163
12.6 rRNA二級結構分析與應用 164
12.6.1 RNA二級結構模型的手動(dòng)構建 164
12.6.2 RNA二級結構的熱力學(xué)運算與結果合意 165
12.6.3 tRNA的二級結構及應用 165
12.6.4 rDNA內含子與長(cháng)度變異區段 165
12.6.5 基于rRNA二級結構的rDNA手工比對 167
12.6.6 長(cháng)度變異和插入缺失作為共有衍征 167
第13章 分子系統學(xué)的建樹(shù)原則與算法 175
13.1 最大簡(jiǎn)約法真的缺少模型么？ 175
13.1.1 最大簡(jiǎn)約法與優(yōu)化式簡(jiǎn)約 177
13.1.2 布萊默支持指數 178
13.2 最大似然法與進(jìn)化模型 179
13.2.1 似然原則與最大似然法 179
13.2.2 分子序列進(jìn)化模型的類(lèi)型 180
13.2.3 堿基替換模型的確定 180
13.2.4 rRNA二級結構中的堿基對替換模型 181
13.2.5 氨基酸替換模型 183
13.3 貝葉斯分析及其并行化 183
13.3.1 實(shí)現貝葉斯分析的原理 184
13.3.2 貝葉斯分析的并行化 186
13.4 數據不相合性檢測 187
13.5 系統誤差與隨機誤差 188
13.6 個(gè)老套卻仍然現實(shí)的問(wèn)題：聯(lián)合還是合意？ 189
第五部分 形態(tài)進(jìn)化的分子系統學(xué)思考
第14章 分子鐘與中性進(jìn)化 197
14.1 分子鐘 197
14.1.1 模型與檢驗 197
14.1.2 在形態(tài)進(jìn)化研究中的應用 198
14.2 中性進(jìn)化 198
14.2.1 模型與檢驗 198
14.2.2 在形態(tài)進(jìn)化研究中的應用 200
第15章 進(jìn)化發(fā)育：分子與形態(tài)之間的橋梁 202
15.1 生物發(fā)生律與馮貝爾法則 202
15.2 動(dòng)物身體模式的建成 203
15.3 與局部形態(tài)相關(guān)的基因 205
15.4 無(wú)中生有：有希望的怪物 206
15.5 有中生有：結構演化與新功能 206
15.6 表觀(guān)遺傳 207
15.7 個(gè)體發(fā)育與系統發(fā)育 207
15.8 發(fā)育或形態(tài)特征作為共有衍征 208
15.9 原位雜交簡(jiǎn)介 208
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