R語(yǔ)言在海洋漁業(yè)中的應用/全國高等院校海洋專(zhuān)業(yè)規劃教材簡(jiǎn)介，目錄書(shū)摘

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內容簡(jiǎn)介:　　《R語(yǔ)言在海洋漁業(yè)中的應用/全國高等院校海洋專(zhuān)業(yè)規劃教材》第1章至第5章簡(jiǎn)要介紹了R的基本使用方法，以使讀者能掌握R的基本語(yǔ)法與用法，特別是R獲取幫助、讀取與漁業(yè)有關(guān)的各種數據及利用R進(jìn)行必要的圖形繪制的方法。由于海洋漁業(yè)研究經(jīng)常需要使用海洋遙感數據、海洋模型同化數據或浮標數據，這些數據通常使用nc或hdf格式存儲，因此，《R語(yǔ)言在海洋漁業(yè)中的應用/全國高等院校海洋專(zhuān)業(yè)規劃教材》除了介紹TXT與EXCEL文件讀取方法外，同時(shí)也比較詳細地介紹了nc、hdf文件的讀取方法。除一般圖形繪制外，《R語(yǔ)言在海洋漁業(yè)中的應用/全國高等院校海洋專(zhuān)業(yè)規劃教材》也比較詳細地介紹了地圖、矢量與柵格數據疊加等圖形繪制方法，以更好地滿(mǎn)足漁業(yè)數據分析的需要。由于R涉及的內容廣泛，如圖形繪制，除基本繪圖軟件包外，lattice、ggplot等軟件包提供了更豐富的圖形繪制方法，因此，如需繪制更美觀(guān)、更復雜的圖形或圖像，讀者仍需要參考其他有關(guān)R的參考書(shū)，但更為重要的是讀者需要掌握R獲取在線(xiàn)幫助的方法，這是學(xué)習、掌握R的重要途徑。
　　《R語(yǔ)言在海洋漁業(yè)中的應用/全國高等院校海洋專(zhuān)業(yè)規劃教材》第6章至第12章為R在海洋漁業(yè)中的應用，這些章節主要介紹了海洋漁業(yè)研究中的模型如親體補充量模型、生長(cháng)模型、生物量動(dòng)態(tài)模型等基本概念，介紹了這些模型參數估計、假設檢驗、不確定性分析的基本方法?！禦語(yǔ)言在海洋漁業(yè)中的應用/全國高等院校海洋專(zhuān)業(yè)規劃教材》強調模型誤差結構選擇的重要性，模型選擇、參數估計的不確定性，并充分展示了計算機模擬方法在漁業(yè)資源研究中的應用價(jià)值。貝葉斯模型在漁業(yè)資源的研究中扮演著(zhù)重要角色，《R語(yǔ)言在海洋漁業(yè)中的應用/全國高等院校海洋專(zhuān)業(yè)規劃教材》也較詳細地展示了貝葉斯模型的使用方法。每一章節的例子均提供了數據、R代碼及相關(guān)說(shuō)明，讀者應仔細閱讀這些例子的代碼，并在R中執行，這有利于讀者掌握相關(guān)方法。對這些代碼略做修改，讀者可以直接將其應用于相關(guān)的研究中。

作者簡(jiǎn)介:

目錄:第1章 R語(yǔ)言基礎
1.1 R語(yǔ)言簡(jiǎn)介
1.1.1 R語(yǔ)言的開(kāi)發(fā)歷史
1.1.2 R語(yǔ)言的特色與功能
1.2 R語(yǔ)言的安裝
1.2.1 R軟件的安裝
1.2.2 R軟件包的安裝
1.3 R軟件包的使用與引用
1.3.1 軟件包的載入、卸載與刪除
1.3.2 R或相關(guān)軟件包的引用
1.4 R使用簡(jiǎn)介
1.4.1 R的界面設置
1.4.2 R會(huì )話(huà)
1.4.3 當前工作目錄
1.4.4 R命令
1.4.5 命名字符集
1.4.6 命令行的重復輸入
1.4.7 R命令行的注釋
1.4.8 保存先前命令產(chǎn)生的結果及變量的保存
1.4.9 獲取幫助
1.4.10 R中對象的查找
1.4.11 獲取和設定環(huán)境變量
1.5 R代碼的編輯
1.6 R運行環(huán)境的定制
1.6.1 通過(guò)文件定制R環(huán)境
1.6.2 通過(guò)定義.First（）函數與.Last（）函數定制R環(huán)境
1.6.3 通過(guò)自定義普通函數執行初始化

第2章 R的數據
2.1 R的數據類(lèi)型
2.1.1 數值型（numeric）
2.1.2 字符型（character）
2.1.3 復數型（complex）
2.1.4 邏輯型（logical）
2.2 R中的數據組織方式
2.2.1 向量
2.2.2 純量
2.2.3 數組
2.2.4 數據框
2.2.5 列表
2.2.6 時(shí)間系列數據
2.2.7 因子
2.3 數據類(lèi)型的判斷與強制轉換
2.3.1 數據類(lèi)型的判斷
2.3.2 數據類(lèi)型的強制轉換
2.4 數據的運算
2.4.1 數學(xué)運算
2.4.2 比較運算與邏輯運算
2.4.3 數據的操作函數
2.5 R中的對象
2.6 數據的輸入與輸出
2.6.1 數據的輸入
2.6.2 其他格式文件的輸入
2.6.3 數據的輸出
2.6.4 R中的數據集
2.6.5 其他統計軟件數據的讀取
2.7 數據的編輯
2.7.1 數據編輯方法
2.7.2 數據的融合

第3章 R的圖形繪制
3.1 圖形設備
3.1.1 顯示器圖形設備
3.1.2 文件設備
3.1.3 打印機設備
3.2 繪圖區域與坐標系統
3.2.1 設備區域
3.2.2 圖形區域設置
3.2.3 坐標系統
3.3 高級繪圖函數
3.3.1 簡(jiǎn)單的圖形繪制
3.3.2 顏色繪制
3.3.3 文本字符
3.3.4 坐標軸
3.3.5 線(xiàn)
3.3.6 符號
3.4 其他高級繪圖函數
3.4.1 直方圖
3.4.2 柱狀圖
3.4.3 箱線(xiàn)圖
3.4.4 餅圖
3.4.5 QQ繪制
3.4.6 條件繪制
3.4.7 散點(diǎn)陣列圖
3.4.8 地圖繪制
3.4.9 位圖數據的顯示
3.5 低級繪圖函數
3.5.1 添加圖元
3.5.2 圖形工具函數
3.5.3 圖形邊緣標注與圖例繪制
3.5.4 軸繪制
3.6 圖形疊加繪制
3.7 交互式圖形函數

第4章 概率分布
4.1 單變量連續分布
4.1.1 單變量正態(tài)分布
4.1.2 對數正態(tài)分布
4.1.3 Gaamma類(lèi)分布函數
4.1.4 Beta類(lèi)分布
4.2 單變量離散分布
4.2.1 二項分布
4.2.2 泊松分布
4.2.3 負二項分布
4.3 經(jīng)驗分布及隨機采樣
4.3.1 經(jīng)驗分布
4.3.2 基于樣本的隨機數
4.3.3 一個(gè)隨機測試的例子

第5章 程序控制結構與函數
5.1 表達式
5.1.1 簡(jiǎn)單表達式
5.1.2 復合表達式
5.2 R的控制結構
5.2.1 分支結構
5.2.2 循環(huán)結構
5.3 函數
5.3.1 函數的定義
5.3.2 函數的參數
5.3.3 作用域
5.3.4 返回函數的函數
5.3.5 函數的編輯
5.3.6 程序調試

第6章 漁業(yè)模型及參數估計
6.1 漁業(yè)模型
6.1.1 模型的概念
6.1.2 漁業(yè)模型及假設
6.1.3 參數估計與模型選擇的不確定性
6.2 模型參數的估計方法
6.2.1 最小二乘法估計
6.2.2 最大似然估計
6.2.3 貝葉斯參數估計

第7章 計算機模擬計算方法
7.1 隨機檢驗
7.2 Jackknife方法
7.3 Bootstrap方法
7.3.1 一般Bootstrap方法
7.3.2 平衡Bootstrap方法
7.4 蒙特卡洛模擬

第8章 魚(yú)類(lèi)的生長(cháng)
8.1 魚(yú)類(lèi)生長(cháng)的數學(xué)模型
8.1.1 體長(cháng)與體重關(guān)系模型
8.1.2 年齡與體長(cháng)、體重的關(guān)系
8.2 參數估計
8.2.1 年齡與體長(cháng)數據下的參數估計
8.2.2 對于標志放流類(lèi)數據
8.2.3 其他生長(cháng)方程的擬合
8.3 生長(cháng)方程模型的選擇與比較
8.3.1 生長(cháng)方程模型的選擇
8.3.2 生長(cháng)方程模型的比較

第9章 親體與補充量關(guān)系模型
9.1 繁殖模型
9.1.1 B-H模型
9.1.2 Ricker模型
9.1.3 Deriso-Schnute模型
9.1.4 環(huán)境因素在繁殖模型中的作用
9.1.5 繁殖模型的誤差結構
9.2 參數估計
9.2.1 產(chǎn)卵生物量沒(méi)有測量誤差時(shí)的參數估計
9.2.2 產(chǎn)卵生物量存在測量誤差時(shí)的參數估計
9.2.3 存在自相關(guān)性
9.2.4 基于貝葉斯的參數估計

第10章 世代動(dòng)態(tài)模型
10.1 魚(yú)類(lèi)的死亡與世代數量的變化
10.2 單位補充量漁獲尾數與產(chǎn)量
10.3 單位補充量產(chǎn)量模型的應用
10.3.1 計算不同F及開(kāi)捕年齡下的單位補充量產(chǎn)量
10.3.2 等漁獲量曲線(xiàn)圖
10.3.3 F0.1與Fmax

第11章 單位捕撈努力量漁獲量
11.1 基本概念
11.1.1 捕撈努力量
11.1.2 單位捕撈努力量漁獲量（CPUE）
11.1.3 CPUE與資源量的關(guān)系
11.1.4 CPUE與子區域CPUE的關(guān)系
11.1.5 CPUE的標準化
11.2 CPUE標準化模型與模型選擇
11.2.1 CPUE標準化模型
11.2.2 模型的選擇
11.3 CPUE標準化中需注意的問(wèn)題與展望
11.3.1 捕撈量為零數據的處理
11.3.2 交互效應的處理
11.3.3 捕撈努力量的空間分布對CPUE標準化的影響
11.3.4 數據尺度對CPUE標準化的影響
11.3.5 多魚(yú)種漁業(yè)的cPuE標準化
11.3.6 未來(lái)展望
11.4 CPUE標準化的例子
11.4.1 GLM模型對CPUE的標準化
11.4.2 貝葉斯方法對CPUE的標準化
11.4.3 GAM對CPUE進(jìn)行標準化
11.4.4 一般線(xiàn)性混合模型對CPUE的標準化
11.4.5 廣義估計方程對CPUE的標準化

第12章 生物量動(dòng)態(tài)模型
12.1 漁業(yè)資源評估模型的基本結構
12.2 生物量動(dòng)態(tài)模型的種群動(dòng)態(tài)
12.2.1 種群生物量動(dòng)態(tài)模型
12.2.2 Schaefer生物量動(dòng)態(tài)模型
12.3 生物量動(dòng)態(tài)模型的參數估計
12.3.1 回歸方法
12.3.2 時(shí)間系列方法
12.3.3 Bootstrap方法估計參數的置信區間
12.3.4 貝葉斯方法
12.4 投影與風(fēng)險分析
12.5 r的先驗設置
參考文獻