《生物數據分析和生物系統模型中的參數估計》是將生物大數據與生物信息技術(shù)、系統建模結合起來(lái)的高水平前沿專(zhuān)著(zhù)!
《生物數據分析和生物系統模型中的參數估計》是在作者對時(shí)間序列基因表達數據和非線(xiàn)性動(dòng)態(tài)生物系統參數估計領(lǐng)域的研究論文基礎上完成的,它包括5個(gè)部分:第1部分給出了本書(shū)的研究背景和結構綱要;第2部分包括5章,每章介紹一個(gè)時(shí)間過(guò)程的基因表達數據的方法;第3部分也包括5章,每章描述一種用于非線(xiàn)性動(dòng)態(tài)分子生物系統的參數估計方法;第4部分介紹了有關(guān)基因調控網(wǎng)絡(luò )的建模及參數估計研究現狀與進(jìn)展情況;第5部分為附錄?!渡飻祿治龊蜕锵到y模型中的參數估計》在該領(lǐng)域具有一定前沿性和創(chuàng )新性,《生物數據分析和生物系統模型中的參數估計》的第2~11章主要來(lái)源于作者近幾年發(fā)表在知名的國際會(huì )議或期刊的研究論文?!渡飻祿治龊蜕锵到y模型中的參數估計》可以作為大學(xué)教師、研究生以及研究機構的專(zhuān)家、學(xué)者和工程師的參考用書(shū)。
田立平教授,具有較強的科研能力和較高的教學(xué)水平,在各類(lèi)期刊發(fā)表教科研論文50多篇,其中SCI6篇,EI18篇。田立平教授主持完成省部級科研項目2項,曾獲河北省教學(xué)成果一等獎一項(排名第五),北京市教學(xué)成果二等獎兩項(排名分別為*一和第二);河北省冶金廳科技進(jìn)步二等獎,北京市高等院校教學(xué)名師獎;唐山市優(yōu)秀教師;北京市中青年骨干教師,北京物資學(xué)院優(yōu)秀本科教學(xué)十佳教師,目前為北京市優(yōu)秀教學(xué)團隊《數學(xué)公共基礎系列課程教學(xué)團隊》帶頭人,北京市優(yōu)秀教學(xué)團隊《數學(xué)建模系列課程教學(xué)團隊》主要成員。
前言
第1章 導論 1
1.1 背景 1
1.2 本書(shū)的框架 2
第2章 周期性基因鑒定的參數估計方法 6
2.1 引言 6
2.2 方法 8
2.2.1 基因的周期性表達模型 8
2.2.2 假設檢驗 9
2.3 實(shí)驗結果與討論 10
2.4 結論和展望 13
參考文獻 14
第3章 從微陣列時(shí)間過(guò)程表達探測近似周期性表達的基因 15
3.1 引言 15
3.2 方法 17
3.2.1 基因近似周期性的表達模型 17
3.2.2 假設檢驗 19
3.3 實(shí)驗結果與討論 20
3.4 結論和展望 25
參考文獻 25
第4章 偽周期性基因表達譜鑒定 28
4.1 引言 28
4.2 方法 30
4.2.1 偽周期性基因表達序列的鑒別模型 30
4.2.2 假設檢驗 32
4.3 實(shí)驗結果與討論 33
4.4 結論和展望 35
參考文獻 36
第5章 基于非線(xiàn)性模型的周期性表達基因數據的聚類(lèi)分析法 38
5.1 背景 38
5.2 方法 40
5.2.1 周期性表達基因模型 40
5.2.2 基于聚類(lèi)分析的非線(xiàn)性模型 42
5.2.3 驗證 43
5.3 實(shí)驗結果與討論 44
5.4 總結 48
參考文獻 48
第6章 基于非線(xiàn)性模型的時(shí)間序列基因表達數據分析 51
6.1 背景 51
6.2 方法 53
6.2.1 時(shí)間序列基因數據的非線(xiàn)性模型 53
6.2.2 非線(xiàn)性模型的顯著(zhù)性分析 55
6.2.3 基于非線(xiàn)性模型的聚類(lèi)分析 56
6.2.4 數值計算 57
6.3 基因表達數據在現實(shí)生活中的應用 61
6.4 結論 62
參考文獻 63
第7章 有約束的交互最小二乘法對S系統生物網(wǎng)絡(luò )模型的參數估計 66
7.1 引言 66
7.2 算法描述 68
7.3 數值算例 70
7.4 結論 73
參考文獻 73
第8章 線(xiàn)性分式模型中參數估計的迭代最小二乘法 75
8.1 引言 75
8.2 算法描述 76
8.3 說(shuō)明性的例子 79
8.4 結論 82
參考文獻 82
第9章 一種基于冪律的細胞凋亡模型及其參數估計 84
9.1 引言 84
9.2 模型與參數估計 85
9.3 仿真結果 89
9.4 結論和未來(lái)研究方向 91
參考文獻 91
第10章 復雜度分析與動(dòng)態(tài)代謝系統的參數估計 93
10.1 引言 93
10.2 參數估計的模型復雜性分析 94
10.3 參數估計算法 99
10.4 應用 102
10.5 結論和未來(lái)的研究方向 104
參考文獻 104
第11章 基于邏輯和的基因調控網(wǎng)絡(luò )中的參數估計 107
11.1 引言 107
11.2 基于邏輯和的基因調控網(wǎng)絡(luò ) 108
11.3 參數估計方法 110
11.4 說(shuō)明性的例子 112
11.5 結論 114
參考文獻 114
第12章 關(guān)于基因調控網(wǎng)絡(luò )的建模及參數估計的研究現狀及進(jìn)展 117
12.1 研究意義 117
12.2 國內外研究現狀分析 118
12.3 未來(lái)研究的主要問(wèn)題 123
12.4 主要研究?jì)热?、研究目標,以及擬解決的關(guān)鍵科學(xué)問(wèn)題 124
12.5 擬采取的研究方法、技術(shù)路線(xiàn)、實(shí)驗手段、關(guān)鍵技術(shù)、特色及創(chuàng )新點(diǎn) 127
參考文獻 129
附錄 132
附錄A 一元線(xiàn)性回歸的分析及最小二乘估計 132
附錄B 多元統計分析中的聚類(lèi)分析 135
附錄C 數據挖掘中的聚類(lèi)分析 137
附錄D F分布定義及性質(zhì) 141